今天给各位分享生信linux学习视频的知识，其中也会对Linux生物信息学进行解释，如果能碰巧解决你现在面临的问题，别忘了关注本站，现在开始吧！
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ATAC-seq专题---生信分析流程
ATAC-seq信息分析流程主要分为以下几个部分：数据质控、序列比对、峰检测、motif分析、峰注释、富集分析，下面将对各部分内容进行展开讲解。 下机数据经过过滤去除接头含量过高或低质量的reads，得到clean reads用于后续分析。
ChIP-Seq原理是：首先通过染色质免疫共沉淀技术（ChIP） 特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段 ，并对其进行纯化与文库构建；然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。ATAC-seq是 全基因组范围 内，找出所有的OCR。
相比起来，ATAC-seq的重复性，比MNase-seq和DNase-seq的更强，操作起来也更加简单，而且只需要很少的细胞/组织量，同时出来的信号更加漂亮。目前已经是研究染色质开放性首选的技术方法。
下面的内容主要介绍这一节课程中RNA-Seq和ChIP-Seq的整合分析中提到的两种方法： 一是直接比较 ，即首先得到差异基因与ChIP-Seq靶基因的overlap，然后选择一些关键基因比较一下谱图。
使用DiffBind包提取ATAC-seq数据中的差异peaks主要包括以下几个步骤：准备输入数据：首先，需要准备ATAC-seq数据，这通常是peak调用软件（如MACS2）产生的peak文件。对于多个样本，你需要为每个样本准备一个peak文件。
生物背景入门生物信息学,需要补哪些计算机知识?
1、其次，你需要学习计算机科学和信息技术的基础知识，包括编程语言（如python、R等）、数据结构和算法、数据库管理等。这些技能将帮助你处理和分析生物数据。
2、熟练掌握一门就好了，非常推荐Python，当然生物信息学领域用的最多的还是Perl 对C，R什么的也得了解一点，能读别人的代码最好了。
3、生物：普通生物学、生物化学、分子生物学、细胞生物学、遗传学、基因组 学、蛋白组学等；计算机：计算机基础、C语言、C++、JAVA、Perl、数据结构、数据库、数据挖掘、计算机算法、软件工程。
4、基础知识：首先，你需要对生物学有一定的了解，包括基本的生物学原理和实验技术。同时，你也需要掌握一些计算机科学的基础知识，如编程语言、数据结构和算法等。
5、基础知识包括LINUX基本操作，python或perl随便一门编程语言，R语言常用，要学。熟悉各大生物数据库（主要查询和下载数据），熟悉生信常用到的格式，常用软件的使用。
6、我是第一种，以微生物为主，所以我只能就我自己来看。读到现在我觉得，对我用处最大的几门是生物化学、分子生物学、细胞生物学、微生物学以及专讲生物信息学的一些书籍。
零基础学linux,有什么好的网课***推荐吗
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LINUX快速入门第八章:Shell基础
Bash Shell 是 GNU 计划的重要工具之一，也是 GNU 系统中标准的 Shell。Bash 与 sh 兼容，所以许多早期开发出来的 Bourne Shell 程序都可以继续在 Bash 中运行。现在使用的 Linux 就使用 Bash 作为用户的基本 Shell。
Shell基础：你可以通过打开Linux的terminal（终端）来执行Shell命令。Shell的种类有很多种，例如CSH，Bourne Shell，Korn Shell。在现在的大多数Linux发行版中，默认的Shell一般都是Bourne again shell（bash）。
方法一：通过系统自带的检索系统，我们可以轻松找到终端（Terminal），单击即可打开。检索系统可以通过快速启动栏右上角的按钮启动。方法二：为了之后可以方便的打开终端，建议将终端固定在快速启动栏。
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